Справочник
Синтетическая биология и базовые технологии
Базовые технологии биоэкономики: редактирование и синтез геномов, автоматизация проектирования, чтение и анализ биологических данных.
Сектор базовых технологий — это инструментарий, которым пользуются все остальные сектора. Три кластера: геномная инженерия — изменение живого, от точечных правок до целых геномов; биофаундри и дизайн — автоматизация цикла «спроектировал — собрал — проверил» и физические пределы каждой его стадии; биоинформатика и омиксы — чтение и осмысление данных, которые эти две первые кластерные технологии производят.
Сквозной мотив — цена длины и специфичности: синтез ДНК платит геометрически за каждое основание, дизайн белка — за каждый контакт, а сборка генома — за каждый повтор в последовательности. Второй мотив — измерение как предел итерации: конвейер фаундрии ускоряет не биологию, а круги обратной связи, и их число упирается в качество измерения.
Вход — метаболическая инженерия: клетка как сеть потоков — общий язык проектирования.
- Геномная инженерия Редакторы, меняющие двунитевой разрыв на свои ограничения, минимальные геномы с неизвестными генами и самое слабое допущение биобезопасности.
- Биофаундри и дизайн От метаболической инженерии до ДНК-оригами: физические пределы проектирования биологических систем и что делает автоматизация фаундрий.
- Биоинформатика и омиксы Артефакты, следующие из способа приготовления пробы, обмен между охватом и опознанием молекулы и заявленные пределы моделей на последовательностях.